Η δημιουργία της λίμνης άλλαξε ριζικά την οικολογία της ευρύτερης περιοχής. Στα νερά της βρίσκουν καταφύγιο πολλά είδη ψαριών και πτηνών, αλλά η κατακράτηση των υδάτων προκάλεσε πτώση του υδροφόρου ορίζοντα στον κάμπο της Άρτας, καθώς δεν υπήρχε πλέον αρκετό νερό για να ανανεώσει τα νερά που αξιοποιούνταν στις καλλιέργειες. Για να αντιμετωπιστεί το πρόβλημα κατασκευάστηκε στη βάση του φράγματος ένα δεύτερο χαμηλότερο (Πουρνάρι ΙΙ), ώστε να υπάρχει πάντοτε νερό στην κοίτη του Άραχθου. Δυστυχώς δεν υπάρχει εύκολη πρόσβαση στο κυρίως φράγμα ή στις όχθες της λίμνης.