Στα ελληνιστικά χρόνια η Λιμναία επεκτάθηκε σημαντικά. Αποτελούνταν από την ακρόπολη και την πόλη, η οποία κάλυπτε την πλαγιά του λόφου και κατέβαινε προς τη θάλασσα (σήμερα είναι θαμμένη κάτω από τη σύγχρονη Αμφιλοχία). Η πόλη προστατευόταν από τα μακρά τείχη που είναι ακόμα ορατά. Στη θάλασσα πρέπει να υπήρχε κάποιο προάστιο και εγκαταστάσεις για να αράζουν τα πλοία. Η οχύρωση ενισχυόταν από τετράγωνους πύργους: τα θεμέλια τριών είναι ορατά στα δεξιά του εισερχομένου από το σημερινό δρόμο, ενώ ακριβώς στα αριστερά του βρισκόταν η αρχαία είσοδος που προστατευόταν από δύο πύργους. Εκεί κατέληγε ο δρόμος από το λιμάνι της Λιμναίας.