Οι Αμβρακιώτες βρέθηκαν σε δύσκολη θέση. Η πόλη ανήκε στον Ηρακλή, ήταν όμως φανερό ότι έπρεπε να τιμήσουν και τον Απόλλωνα. Επέλεξαν να τον λατρεύουν ως προστάτη του δρόμου και των αποίκων, αλλά και ως σωτήρα από τις εμφύλιες διαμάχες και την τυραννία. Σύμβολο του θεού ήταν ο βαίτυλος, ο ιερός λίθος, που εικονιζόταν στα νομίσματα της πόλης καθώς και στα κεραμίδια των ναών και των δημοσίων οικοδομημάτων. Στα βυζαντινά χρόνια, οι λίθοι του ναού χρησιμοποιήθηκαν σε άλλα κτήρια και ο χώρος μετατράπηκε σε νεκροταφείο. Μάλιστα, μία από τις γυναίκες που ενταφιάστηκαν εδώ φορούσε φόρεμα από επίχρυσες και επάργυρες μεταλλικές ίνες, ένα εξαιρετικά πολυτελές και πανάκριβο ύφασμα που είχε έρθει από κάποιο μεγάλο αστικό κέντρο.