Η κατάσταση στο Μεσολόγγι ήταν κρίσιμη. Η πόλη δεν ήταν προετοιμασμένη για μακρόχρονη πολιορκία αλλά ο Μπότσαρης και οι 35 άνδρες που είχε μαζί του αρνήθηκαν να την εγκαταλείψουν. Τα γυναικόπαιδα και οι ηλικιωμένοι μεταφέρθηκαν στα Επτάνησα και η φρουρά περίμενε τους Οθωμανούς. Αυτοί δεν συνειδητοποίησαν πόσο αδύναμη ήταν η φρουρά και προτίμησαν να πετύχουν την παράδοση της πόλης με διαπραγματεύσεις. Οι συνομιλίες του Μπότσαρη με τους πασάδες κράτησαν μέρες, δίνοντας χρόνο στους αμυνόμενους να ενισχύσουν τα τείχη και τον ελληνικό στόλο να ξεφορτώσει προμήθειες. Ο Μπότσαρης είχε σώσει το Μεσολόγγι αλλά δεν έζησε για πολύ. Τον Αύγουστο του 1823 σκοτώθηκε σε επίθεση στο Καρπενήσι κατά 3500 Αλβανών. Ο ανδριάντας που τιμά τον σωτήρα του Μεσολογγίου αποκαλύφθηκε το 2014.